Christlich-archäologische Lehrinhalte werden an der FAU in unterschiedliche Bachelor- und Masterstudiengänge integriert, die eine ganze Bandbreite verschiedener Wissenschaftsdisziplinen von der Archäologie über Theologie und Kunstgeschichte umfassen. Eine Besonderheit ist die Beteiligung am B.A.-Studiengang Digitale Geistes- und Sozialwissenschaften (DigiHumS), in den die Erlanger Christliche Archäologie Kompetenzen im Feld der Visual Digital Humanities einbringt.

Auch Promotion (Dr. phil.) und Habilitation sind möglich, vgl. Promotions- und Habilitationsordnungen der Philosophischen Fakultät (mit Fachbereich Theologie).